Семинар организован на базе Научно-образовательного центра «Суперкомпьютерные технологии». Тематика докладов охватывает все стороны использования суперкомпьютеров, параллельных вычислительных систем и методов распределенной обработки данных для решения больших вычислительных задач. Семинар носит ярко выраженный междисциплинарный характер, однако различные нюансы использования суперкомпьютерных технологий представляют интерес для исследователей из самых разных областей.
ПРОГРАММА СЕМИНАРА
1. 16:30 - 17:15
| Краснопольский Б.И. | к.ф.-м.н., в.н.с. |
| Медведев А.В. | ведущий программист НИИ механики МГУ |
О роли неблокирующих коммуникаций при реализации алгоритмов линейной алгебры на суперкомпьютерах
Эффективное использование механизмов асинхронного обмена данными является необходимым условием для разработки масштабируемых алгоритмов линейной алгебры с разреженными матрицами. Новые возможности стандарта MPI-3, в частности, появление неблокирующих коллективных операций, явились толчком к разработке модифицированных математических алгоритмов, ориентированных на перекрытие времени глобальных коммуникаций и вычислений. Однако, не всегда неблокирующие операции оказываются на практике асинхронными.
В докладе приводится описание разработанной методики тестирования степени асинхронности неблокирующих локальных и глобальных коммуникаций. Демонстрируется важность правильного понимания работы неблокирующих коммуникаций на используемом вычислительном оборудовании и обсуждаются примеры опубликованных в литературе ошибочных выводов о свойствах алгоритмов, использующих асинхронные неблокирующие глобальные коммуникации.
Ссылки по теме работы:
1) B. Krasnopolsky, Revisiting performance of BiCGStab methods for solving systems with multiple right-hand sides // Computers & Mathematics with Applications, 2019, https://doi.org/10.1016/j.camwa.2019.11.025
2) A. Medvedev. Towards benchmarking the asynchronous progress of non-blocking MPI point-to-point and collective operations // Proceedings of ParCo conference, 2020 (in press).
3) B. Krasnopolsky. Predicting Performance of Classical and Modified BiCGStab Iterative Methods // Proceedings of ParCo conference, 2020 (in press).
4) A. Medvedev. IMB-ASYNC benchmark. https://github.com/a-v-medvedev/mpi-benchmarks
2. 17:15 - 18:00
| Докукин С.А. | аспирант Физический факультет МГУ |
Докукин С.А., аспирант Физический факультет МГУ
Исследование самоорганизации и физических свойств поверхностного сплава платина-медь
Работа посвящена компьютерному моделированию формирования и физических свойств поверхностных сплавов Pt-Cu. В рамках данной работы были подобраны потенциалы межатомного взаимодействия Pt-Cu и Pt-Pt, разработан численный метод моделирования формирования поверхностных сплавов Pt-Cu. Были исследованы атомные механизмы, динамика и условия роста пальцеобразных выростов и фрактальных кластеров в поверхностном сплаве Pt/Cu(111). В поверхностном сплаве Pt/Cu(001) был исследован фазовый переход порядок-беспорядок при изменении концентрации платины, динамика растворения кластеров платины в меди, а также влияние атомов платины на скорость электромиграции вакансионных островов. Все результаты были получены на суперкомпьютерах Ломоносов и Ломоносов 2.
Ссылки по теме работы:
1) Dokukin, S. A.; Kolesnikov, S. V.; Saletsky, A. M. et al. Growth of the Pt/Cu(111) surface alloy: Self-learning kinetic Monte Carlo simulations. JOURNAL OF ALLOYS AND COMPOUNDS. 2018. V. 763. P. 719-727.
2) Dokukin, S. A.; Kolesnikov, S. V.; Saletsky, A. M. Efficient energy basin finding method for atomistic kinetic Monte Carlo models. COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE. 2018. V. 155. P. 209-215.
3) Dokukin, S. A.; Kolesnikov, S., V; Saletsky, A. M. Dendritic growth of the Pt-Cu islands on Cu(111) surface: Self-learning kinetic Monte Carlo simulations. SURFACE SCIENCE. 2019. V. 689, UNSP 121464.
4) Dokukin, S. A.; Kolesnikov, S. V.; Saletsky, A. M. Diffusion-mediated processes in Pt/Cu(001) surface alloy. SURFACE SCIENCE. 2020. V. 692, 121515.