заседание семинара
«Суперкомпьютерные технологии
в науке, образовании и промышленности»
| Председатель организационного комитета семинара | |
 |
В.А. Садовничий академик, ректор Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова |
Сопредседатели организационного комитета |
|
 |
Вл.В. Воеводин чл.-корр. РАН, директор НИВЦ МГУ |
 |
И.А. Соколов академик, декан факультета ВМК МГУ |
 |
А.В. Тихонравов д.ф.-м.н., профессор, НИВЦ МГУ |
Ученый секретарь семинара |
|
| Д.К. Кутов НИВЦ МГУ |
|
Семинар организован на базе Научно-образовательного центра «Суперкомпьютерные технологии». Тематика докладов охватывает все стороны использования суперкомпьютеров, параллельных вычислительных систем и методов распределенной обработки данных для решения больших вычислительных задач. Семинар носит ярко выраженный междисциплинарный характер, однако различные нюансы использования суперкомпьютерных технологий представляют интерес для исследователей из самых разных областей.
ПРОГРАММА СЕМИНАРА
16:20
| Н.Б. Гудимчук д.ф.-м.н., с.н.с. кафедры биофизики физического факультета МГУ; зав. лаб. биофизики цитоскелета ЦТП ФХФ РАН |
| В.В. Александрова м.н.с. кафедры биофизики физического факультета МГУ |
| В.А. Фёдоров к.ф.-м.н., н.с. биологического факультета МГУ |
| Е.Г. Холина к.б.н., ассистент биологического факультета МГУ |
| И.Б. Коваленко д.ф.-м.н., в.н.с. биологического факультета МГУ |
| Ф.И. Атауллаханов академик РАН, профессор, д.б.н., научный руководитель ЦТП ФХФ РАН; профессор Университета Пенсильвании |
От молекул до клеток: компьютерное моделирование динамики микротрубочек на суперкомпьютере Ломоносов-2
Микротрубочки представляют собой полимеры белка тубулина, которые входят в состав клеточного скелета и играют важную роль в различных аспектах физиологии клеток. Их неравновесная динамика, необычные механические свойства, многообразие функций, а также медицинская значимость в качестве мишеней для препаратов химиотерапии рака на протяжении более тридцати лет стимулировали активные экспериментальные и теоретические исследования микротрубочек. В данном докладе будут представлены результаты компьютерного моделирования микротрубочек нашей группой за последнее десятилетие. Наши вычислительные усилия были направлены на понимание микротрубочек через набор моделей на нескольких пространственных и временных масштабах, начиная с изучения свойств димеров тубулина как строительных блоков и дальнейшего объяснения того, как эти свойства способствуют возникновению процессов на более крупных масштабах, таких как сборка/разборка и генерация сил микротрубочками. Методология включала различные подходы — от полноатомной молекулярной динамики до более "крупнозернистых" вариантов описания, таких как броуновская динамика и моделирование методом Монте-Карло. В докладе мы обсудим некоторые технические аспекты моделирования, такие как вычислительная производительность различных типов симуляций, текущие ограничения и перспективные направления для дальнейшего описания динамики микротрубочек, а возможно, и многих других клеточных систем, с использованием мульти-масштабного подхода.
Заседание семинара пройдет в смешанном формате: очно и в форме вебинара на платформе Контур.Толк.
Для участия в вебинаре просим Вас занести свои данные в форму:
https://forms.yandex.ru/cloud/67110553eb61464934cbb2d5/
На указанный Вами адрес электронной почты впоследствии придёт ссылка на конференцию в Контур.Толк (https://kontur.ru/talk).
Обращаем Ваше внимание, что для более высокого качества видеосвязи мы рекомендуем заранее установить приложение Контур.Толк и заходить в конференцию через приложение, НЕ через браузер. Для участия в конференции регистрация в Контур.Толк НЕ требуется.
Приложения (десктоп и мобильное), можно скачать по ссылке https://kontur.ru/talk#app.
Если Вы планируете очно участвовать в работе семинара, и у вас нет пропуска в МГУ, необходимо не позднее 5 мая (воскресенье) заполнить форму.
Обращаем внимание, что проход будет разрешен только через южный вход Второго корпуса МГУ и только во время работы семинара.