заседание семинара
«Суперкомпьютерные технологии
в науке, образовании и промышленности»
| Председатель организационного комитета семинара | |
 |
В.А. Садовничий академик, ректор Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова |
Сопредседатели организационного комитета |
|
 |
Вл.В. Воеводин чл.-корр. РАН, директор НИВЦ МГУ |
 |
И.А. Соколов академик, декан факультета ВМК МГУ |
Ученый секретарь семинара |
|
| Мортиков Е.В. к.ф.-м.н., НИВЦ МГУ |
|
Семинар организован на базе Научно-образовательного центра «Суперкомпьютерные технологии». Тематика докладов охватывает все стороны использования суперкомпьютеров, параллельных вычислительных систем и методов распределенной обработки данных для решения больших вычислительных задач. Семинар носит ярко выраженный междисциплинарный характер, однако различные нюансы использования суперкомпьютерных технологий представляют интерес для исследователей из самых разных областей.
ПРОГРАММА СЕМИНАРА
16:30
| Шайтан А.К. | доцент, д.ф.-м.н., кафедра биоинженерии биологического факультета МГУ |
Компьютерные технологии и проблема понимания работы ДНК в живых системах
Сложность и мощность современных компьютерных информационных систем достигла впечатляющих высот, они могут соперничать по сложности с живыми организмами - самыми сложными объектами, созданными природой. Тем не менее, наше понимание того, как живые системы функционируют на молекулярном уровне, остается далеко не полным. Информационное содержание генетических программ, кодируемых ДНК в геноме человека, составляет менее 900 мегабайт. Однако комплексное понимание молекулярных механизмов, лежащих в основе интерпретации этих программ, является существенной проблемой, которая, возможно, будет решена в 21 веке благодаря комбинации высокопроизводительных автоматизированных экспериментальных подходов и компьютерных технологий. Растущие возможности современных компьютерных систем и алгоритмов являются в конечном итоге необходимым компонентом для решения этой проблемы. В этом докладе я продемонстрирую, как суперкомпьютерное моделирование позволяет нам понять молекулярные механизмы функционирования ДНК в живых системах, понимая ее динамическое взаимодействие с белками.
Статья о суперкомпьютерном моделировании упаковки ДНК в нуклеосомы:
Armeev,G.A., Kniazeva,A.S., Komarova,G.A., Kirpichnikov,M.P. and Shaytan,A.K. (2021) Histone dynamics mediate DNA unwrapping and sliding in nucleosomes. Nat Commun., 12. https://www.nature.com/articles/s41467-021-22636-9
Статья о применении инженерных подходов в биологии:
Грешнова,А.А., Глухов,Г.С. and Шайтан,А.К. (2019) Синтетическая биология: конструирование живого. Химия и Жизнь - XXI век. https://engbio.ru/HiZ_9_2019_synbio.pdf
Заседание семинара пройдет в форме вебинара на платформе Zoom.
Для участия в вебинаре просим Вас занести свои данные в Google-таблицу:
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1V6ymXdsQSrqMcR86bLQCgQcVi4D9gdcjY1MtErLAzjc/edit?usp=sharing
На указанный Вами адрес электронной почты впоследствии придёт ссылка на Zoom-конференцию.